Таможенные склады, своего рода свободная зона, где экономические агенты могут хранить свои товары без применения импортных пошлин и мер экономической политики или отечественные товары, предназначенные для экспорта, используются не только в классических сделках. Такое заключение было сделано Счетной палатой, которая рекомендовала усилить бдительность и надзор, а также внести коррективы в законодательную базу.

В отчете Счетной палаты приводится пример экономического агента, который импортировал 400 автомобилей класса люкс стоимостью почти 693 миллиона леев и поместил их на "таможенный склад". Впоследствии владельцы сменились, и автомобили были реэкспортированы в другие страны на сумму 846 миллионов леев, что на 153 миллиона леев больше статистической стоимости при поступлении на таможенный склад. Для некоторых люксовых автомобилей стоимостью 100 миллионов леев страной сделки были Объединенные Арабские Эмираты, которые не соблюдают международные стандарты прозрачности.

Лекарства на сумму 837 млн. леев были импортированы из Италии и впоследствии реэкспортированы с помощью перечисленных таможенных процедур, в основном в Российскую Федерацию, а странами совершения сделки были Мальта и Объединенные Арабские Эмираты.

Счетная палата установила, что деятельность некоторых таможенных складов, помещающих товары под процедуру свободной экономической зоны и впоследствии реэкспортирующих их, с эффектом приостановления всех или части импортных/экспортных пошлин, требует строгого контроля со стороны таможенного органа, а лазейки в существующей правовой базе должны быть устранены. Вопреки закону, некоторые владельцы таможенных складов не представляли в таможенный орган отчеты об учете хранимых товаров, не обеспечили работоспособность систем видеонаблюдения склада, за что Таможенная служба отозвала 4 разрешения на складирование, в том числе одно разрешение было отозвано из-за нарушений, допущенных с гражданским оружием и боеприпасами, а у 5 экономических операторов было приостановлено действие разрешений на складирование.

В связи с несовершенством законодательной базы, т.е. некоторых положений Таможенного кодекса, противоречащих Закону о регулировании посредством разрешения предпринимательской деятельности, суды предоставляют владельцам таможенных складов право приостанавливать, отзывать и восстанавливать действие разрешения на хранение, выданного таможенным органом. Было выявлено несоответствие между некоторыми положениями Таможенного кодекса и Положением о применении одобренных таможней видов обработки или использования, предусмотренных Таможенным кодексом, утвержденным постановлением Правительства Российской Федерации от 2 ноября 2005 года № 1140. Так, согласно Таможенному кодексу, приостанавливающая таможенная процедура "таможенное складирование" может быть завершена путем помещения товаров под иной таможенно разрешенный режим или использование - помещение товаров в свободную зону, тогда как согласно Положению для завершения таможенной процедуры таможенного складирования отсутствует таможенно разрешенный режим или использование - "свободной экономической зоны".